当植物发生病害的时候，通过植物病菌检测仪鉴别其病害种类和状况，有利于防止其扩散和传播，保护农业生产。要想做好植物病害监测工作，就需要了解其发病机理。

一般植物的病害分为非传染性病害、传染性病害两大类，传染性病害较为严重，容易造成大面积的农业灾害，传染性病害一般是由病菌侵害发生的，能够传染。引起传染性病害的病菌大多数为真菌，其次就是病毒和细菌，以及线虫和寄生性种子植物等。

对于这些植物病害情况，前期诊断很重要，因此在现代农业中，为了做到未雨绸缪，开始使用植物病菌检测仪来进行植物病害的检测，可以在植物的发病初期，就诊断出其发病状况，从而最大限度的降低农业损失，而且效果也好。植物病害的诊断，首先应该是区别是病害还是伤害，伤害是没有病变过程，病害是有病变过程的。如果是病害，还要区别是非传染性的，还是传染性的病害。植物病害的诊断是一项比较复杂的工作，以往由于缺少仪器的支持，病毒病害与非传染性病害容易混淆，因为病毒病害在外表看不出病症，区别病毒病与非传染性病害，除根据有无传染现象外，还可根据病害的发生特点。当然，现在借助植物病菌检测仪诊断植物病害则更加简单和款速，非常适合应用于现代大面积的农业生产作业中。