食品采样容器和器具是进行食品检测中的重要器具，因此在选择和清洗上非常严格，一般来说，采样容器根据检验项目，选用硼硅玻璃瓶或聚乙（丙）烯塑料瓶，必须能够用塞或盖紧紧密封。玻璃瓶要容易洗涤；聚乙烯瓶塑料瓶不易破碎和冻坏，便于运送；所有盛样容器必须有和样品一致的标记。盛样品的容器应消毒处理，但不得用消毒剂处理容器。微生物样本容器要求耐高压。

食品采样容器和器具的选择原则主要有三个方面的内容，分别是容器不能是新的污染源；容器壁不应吸收或吸附某些待测组分；容器不应与待测组分发生反应。

在食品采样容器和器具的清洗上，也要特别注意，新的采样瓶，应经硝酸浸泡；测有机氯农药的玻璃瓶，则应经铬酸清洁液浸泡，以破坏原来沾污的有机氯。在用酸浸泡之前，先用常水刷洗，尽可能预先除去原来沾污的物质。用铬酸清洁液浸泡后必须用自来水冲洗7～10次，再用纯水淋洗，盛放过高浓度某种组分的样品瓶最好弃之不用。