种子是传播烟草病原物最重要的途径之一，通常种子病害包括病原物存在于种子表面或内部，以及病原体或潜带病原体的病残体直接或间接混杂于种子之间。主要危害方式：一是危害种子本身，二是种传病害。种子带病率的高低，决定于当年良繁田发病的轻重以及种子处理加工的条件，种传病害危害的轻重，决定于种子带病率的高低及当年环境条件的适宜性。烟草种子处理与加工的目的之一，就是通过一系列对种子的操作控制和消毒处理减少烟草病害的发生。因此烟草病害的防治必须首先树立“健康”种子的概念，抓好种子的处理与加工工作。在种子选择过程中我们可以使用种子风选仪、或者鼓风式净度仪来对种子进行选择。

（1）种子带病部位
　　烟草许多系统侵染的病害，在植株各部分都有病原物存在，病原物能以不同的方式，从种子的不同部位侵入，因此种子的任何部位都可传带病原物。
　　a、种胚带菌
　　b、胚珠带菌
　　c、胚乳受侵
　　d、种皮受侵
　　e、蒴果皮受侵
　　f、种枝茎杆受侵
　　g、种子中混杂物的污染

（2）种子带病的种类
　　种子是各类病原物越冬、越夏的重要场所，一般说，它们是烟草病害的初次侵染来源。随着种子的调运，病原物可以无止境地进行传播。已知真菌引起的植物病害大约有3万多种，据richardsoh《种传病害注释名录》记载，种传真菌的种类有100多个属，1000多个种，细菌引起的病害约有300种，种苗传播的有122种，其中种子传带的75种。第三类为病毒带传。
　　（3）烟草种传主要病害（详见表2）